心血管外科是集医疗、教学、科研为一体的专业学科，科室技术力量雄厚，现有教授1名，副教授1名，主治医师3名，博士生导师及硕士生导师各一名，医学博士2名，护士12名，主管护师1名，护师11名，灌注师1名。现有床位20张，其中监护室床位4张，拥有国际先进呼吸机3台，多功能有创、无创心脏监护仪多台，进口体外循环机一台，主动脉球囊反搏仪一台，静脉输液泵20余台，及进口血气分析仪、心脏除颤仪等。吉大二院心血管外科与心血管内科共同组成了吉林大学心脏病中心，密切配合，优势互补，为心血管疾病的综合治疗提供最佳治疗方案。吉大二院心血管外科手术病种包括：冠心病的外科手术治疗：体外循环下的冠脉搭桥术、非体外循环心脏跳动下的冠脉搭桥术、全动脉化冠脉搭桥术、搭桥手术同时行心梗后室壁瘤切除成形手术、搭桥手术同时行心梗后室间隔穿孔修补术;风湿性心脏病的外科手术治疗：二尖瓣置换术(包括二次换瓣术及左房血栓清除术)或成形术、主动脉瓣置换术或成形术、三尖瓣置换术或成形术、二尖瓣及主动脉瓣双瓣置换术，并可在瓣膜置换术同时行外科射频消融治疗房颤，瓣膜置换术同时行冠脉搭桥手术;先天性心脏病的外科手术治疗，包括以下病种：房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭、肺动脉瓣狭窄、主动脉瓣狭窄、双腔右心室、右室双出口、主动脉缩窄、完全性主动脉弓中断、完全性心内膜垫缺损、法鲁氏四联症、肺动脉闭锁、先天性肺静脉异位引流、先天性大动脉转位，各种先心病合并重度肺动脉高压等;各种大血管疾病如主动脉瘤、主动脉夹层动脉瘤的外科手术治疗，包括：主动脉全弓置换术+象鼻手术、主动脉根部置换术、胸、腹主动脉置换术，外周血管搭桥手术等;各种终末期心脏疾病的手术治疗：心脏移植术。其他心血管外科疾病的手术治疗：慢性缩窄性心包炎的心包剥脱手术;心房粘液瘤等心脏肿瘤的切除手术;慢性肺动脉栓塞取栓手术。自2007年起，吉大二院心血管外科与吉林省民政厅、吉林省慈善总会按照省领导弘扬慈善精神，构建和谐社会的精神，开始对全省城乡特困群体患心脏病需要手术人员实行慈善救助，成为吉林省慈善定点心脏病医院。对全省特困家庭中患有较重心脏病、需要手术、又无力承担全部处置费用的0-14岁儿童实行手术救助。1. 世界上完成了首例冠状动脉右室瘘的瘘口修补加右冠状动脉成形术，达到世界领先水平。2. 完成了国内首例双极射频消融改良MazeⅣ手术治疗房颤的病例，现已完成该类手术16例，在不服用抗心律失常类药物的情况下，全例恢复为窦性心律，2006年11月在第六届全国心胸外科学会做了专题演讲，在房颤的外科治疗上同样达到了世界先进水平。3. 在吉林省内完成首例本省医生主刀的心脏移植手术。4.一期完成主动脉瓣和二尖瓣膜置换，三尖瓣膜成形，心房血栓清除，冠状动脉搭桥及双极射频治疗房颤的复杂手术治疗。5.在吉林省内率先独立开展冠脉搭桥手术，包括常规体外循环下冠脉搭桥术，非体外循环心脏跳动下冠脉搭桥术。现在90%以上采用对患者损伤较小的非体外循环心脏跳动下冠脉搭桥术，其中全动脉化冠脉搭桥术及续贯式血管吻合方法的手术方式，将提高远期血管桥的开通率，同时开展高龄患者的冠脉搭桥手术，例如78岁，有肾功能不全患者的非体外循环不停跳多支冠脉搭桥术，手术成功率达到世界先进水平。6.在吉林省内率先开展冠心病合并室间隔穿孔，室壁瘤的一期手术治疗。7.在吉林省内率先独立开展对夹层动脉瘤的病人实施在脑体分离灌注下行主动脉根部(包括主动脉瓣置换)，升主动脉，全主动脉弓部置换术加象鼻子手术。填补了吉林省在该领域的空白。8.成功完成多例心胸比例在85%以上(最大95%)的晚期风湿性心脏病人的外科治疗。9.成功完成单心房，全肺静脉异位引流，心内膜垫缺损，法鲁氏四联症，右心室双出口等复杂先天性心脏病的外科治疗